Resource Type:
Gene
Organism:
Name:
LOC108202588
Identifier:
LOC108202588
Cross Reference:
| NCBI Gene |  |
|---|
Relationship:
| Relationships |
|---|
| The mRNA, XM_017371061.1, is a part of gene, LOC108202588. |
| The genetic_marker, MK001031 GSSR-032, is located in gene, LOC108202588. |
Analysis:
| Name | Description |
|---|---|
An orange, doubled-haploid, Nantes-type carrot (DH1) was used for genome sequencing. We used BAC end sequences and a newly developed linkage map with 2,075 markers to correct 135 scaffolds with one or more chimeric regions. The resulting v2.0 assembly spans 421.5 Mb and contains 4,907 scaffolds (N50 of 12.7 Mb), accounting for ∼90% of the estimated genome size of 473 Mb. The scaftig N50 of 31.2 kb is similar to those of other high-quality genome assemblies such as potato and pepper. About 86% (362 Mb) of the assembled genome is included in only 60 superscaffolds anchored to the nine pseudomolecules. The longest superscaffold spans 30.2 Mb, 85% of chromosome 4. There are a few different naming schemes for this assembly. First there is the Phytozome genome ID 388: The authors' sequences and gene predictions were also submitted to Phytozome, and can be accessed at this address: https://phytozome-next.jgi.doe.gov/info/Dcarota_v2_0 LNRQ01: These sequences were then assigned GenBank accession numbers starting at LNRQ01000001.1 which corresponds to DCARv2_Chr1, up to LNRQ01004826.1 which corresponds to an unincorporated contig, DCARv2_C10750146. These reside in bioproject PRJNA268187, which is a subproject of umbrella project PRJNA285926. Assembly GCA_001625215.1: The genome assembly was later defined an accession number GCA_001625215.1 for assembly ASM162521v1 which consists of only the 9 chromosome sequences and the plastid assembly, which have accession numbers from CM004278.1 to CM004286.1 for the chromosomes and CM004358.1 for the plastid. The mitochondrial genome was not included because it is classified as an incomplete sequence. RefSeq: The assembly was then later added to RefSeq, and there another new set of identifiers was defined from NC_030381.1 to NC_030389.1 for the chromosomes, and from NW_016089425.1 to NW_016094239.1 for unincorporated scaffolds and contigs. These reside in bioproject PRJNA326436. Note that NCBI substituted different assembled organellar genomes from different genotypes for the RefSeq records. The NCBI Sequence report lists the correspondences between the various naming methods Link to the LNRQ01000000.1 master record at NCBI Raw Reads: Link to SRA accessions used for the genome assembly This genome is available in the CarrotOmics Blast Search | |
The RefSeq genome records for Daucus carota subsp. sativus were annotated by the NCBI Eukaryotic Genome Annotation Pipeline, an automated pipeline that annotates genes, transcripts and proteins on draft and finished genome assemblies. This report presents statistics on the annotation products, the input data used in the pipeline and intermediate alignment results. View the full report at https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/annotation_euk/Daucus_carota_subsp._sativus/100/ Data from this analysis can be viewed in JBrowse here. |
Transcripts:
| Transcript Name | Identifier | Type | Location |
|---|---|---|---|
| XM_017371061.1 | XM_017371061.1 | mRNA | DCARv2_Chr1:3652605..3673638 |
Sequence:
AAGAGTAAAGGAGCTCCGAAGTAGAAAAACAGAGTAGAGCAGAGAGCCAG
GGACTAGTAGTATACGGTATAGTTCGCGTATCTAGGGATCCCTACGATCC
CGTTAGGTGCTCTATCACTGTCGCATACTCTCCAAGTTTGTTTCAACCTG
TTCAAACAAACCCCCGATTTATACATACACACACCACTACACCCTCTCTC
CCTCTATCTACTCCACCATTGCCTCCCTGCTACCTATCTCTCCTCTCTCG
TAACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC
TCTCTCTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCCTCTCCCT
CCCTCCCTCTCTCTCTCTCTCCGAAACTGTTACTTTTCATGTCTAGGTCA
GATTCACTGTTCGATTTTCACCTGCATTGCTAATTACTACTAATCACACT
CTAGATTCGCGAATCTCGGATACGTGTTTCGCCTAATTCAACTCGAATCT
GCCGTTAATTTGTTAATTAGTGTTTGACTTAGGTCTTGACTTCATTAATT
AGGGCTCAGCTACTTGGATCTTGTTTATCTTAGTTACTGTGTCTGTAGAT
TGTAGTACATTGAAGTAAATTGGCGGTGATAGTATAGCTGTGAGTTGAAA
CGAGGTTTCACGTTTTGATTGAATGGAAGTGAATGTTGTAGTTTCGTAAA
TTTTAGTGTGTTTCGGTCTGCTCTCGAATTTCATATTCTATGAAGAATCT
AGAATTTAATTTTAGCTCTATAATATGATTTCATTCATTTTATTACATGT
CATATTTTTGTCAAGCTTCATTTCTTTCCGAATGAAAATTAATATCTGGG
AAAATTATCATTGAGCATTTATAAAAAGATATAGACTGTTAAATTAAGAC
ACTGATAGTTTCTTAAAGTGAAAACCGAGCTGAACATTTATCTGTAAGCT
GGTGTATATATTGCTCATGTGAAATCTTATTGTTATTATTTCCTAGGATA
TCTGCACTCTTATGACATTTCATAAAAAATCCCAACTCCATCCAATTAAA
GTATCATATGTGTTCCGGCAAAAAAAAAAAAAAGTATCATATGTGTATCT
TCTATAATTAGATATCTTTACTTGCCAAGGTTTAGATATATCATATCCGA
GAAAGCATTTTACAAATACCACGTATTGACAAGTTTAAGGTCTAGTTTTA
GTTGCTAAAGTATGATATCAAAATAAGTCTTGATGATAAGATTGTACACT
TTTTGTCTTCTAGATTTTTTTGTTGTAAAGAATATGGTCCACCGAACGAA
TTAAATGGGAAGAGCAATGTTGTAAAAAGCGGGAATCGGACTTAATCGGT
GAAGTCACTGAACAAAGATTAATCGGGGATTAATTGGATTGATCGGGGAT
TAATCGGATGATTAATTGCATAATCGGATATTTAATCAGTTCGACAAGTT
ACGAAACATGGATTAATTGTGATTAATCACCGACTTTTAGAACAGAGGGG
AAGAGTATCAGTGTGACTAAATGATGGTATGATGCGAAGTAATGTCTTTT
CTAGGCCGATGACACATTTATGTAATTTTTGATGGTGATAGGGATGCACC
TTAAAATGTATGGAAAAACATAATGCAAAAAGTATATAACATGTGCAGAA
CATTCATTCACTGTTCCTGTGCTAAATTCTATTCATATTAGAGGGCAACC
TTATAGTATATATGTATGGAGAAGTTAAATATAGAGACCTCTATTTTATT
GGAGACCACGGAGACCATATATGTCATTCAAGCAGTACATATTTTGCATA
ATAATATATATTGTGGTTACTATAATCCTTATTGGTTCATTTCTGGCTTT
AATTTCAGATGGAGAATTCGTCTCCAAACGGGCATCGTTTTAGAAGAATT
TCCCGTCAGTCCTTCGCTGGTAGTCTGAACTTAGATCCACTGGTGAGTTT
GGAACACTTAATTATTTGTTTTAAGTGTTAAAAAAGAAAGTCAGAGATAC
AATAAACATTACATTCTTGGTAAAATGTTACTATTTTATGCACATTAAGG
TCTAAGTTTTAATTTTTTTAAAGCAGACCATTAAACATTTCCTTGAATAA
ACAAACAGCATGAAAGAACTTCTCGTTCCAACTCCTCTCAACTTAAAATA
TACCCAAAGTTTTCTACTATAATTAATAAAATTGTTTTTTCTGGTGTGTG
CCATTGGGTACAATAAAAGCCACTTTTTAATTAGGTGGCAGATTTTTATT
GGCTTCAATCTCATTAATAATGATGGCCCCATGTATGCACAAAAATCTCC
TCCAATAAAAATCTGCTACCCAAGTAAAAAGTAGTTATGGTGTTCCCATG
AGCACACACTAGAAAGAGCCTTGATAAATTATAGCTTAATGAACACATGT
GATCATTAATTAAACAAAGTGAACATCCTTATACTATAATGGGTTGAAAT
TTTCCCCTTAGTGCGTCTTATGTTGTCAAAATGATTGTTATGCTAGATAA
TCTTGAAAGTGTTACTAATAGTAACTTGCAGATCATGGTTATACCTATAC
CTATTAATTCTGGAGTGTTTTTATTAACATGAAAAAAGTAGCACCTTAAC
CTACATTATTTCTTTTCCAGCTTGATGAAAACTTGGAACAGTGGCCACAT
CTTAGTGAACTTGTTCAGTGCTACAGAACTGATTGGGTGAAGGATGATAA
CAAGTATGGGCATTATGAGAGCATCGGCCCAATATCATTTCAAAATCAAA
TTTTCGAGGGACCTGATACTGATATTGAAACAGGTAAACTGAATATAAAA
AGCTAGTAATTGGCATGTTCAGCTCCTTGATTAAGGATGACCTTGGGGCA
GACTTTCTCTGTGCATCTATTTGTTTCTTGCTTTAAGCTTATTTCGTGTA
TTTCGATGACAGAATGTTCTTTTTTTCTGCAAAATAAGAGTTTGACCTAA
TCATAAATTTCACTATATTACGAAGGTACACTGTAAACTTCCCACTGCTT
TCTTATGGACCTGTTGCAATATTAATATGTTGTCTGCAGAAATGCATCTT
GCTAATGCAAGGCAAAATAAGATCGATGATACTGATGACGACATCCCAAG
TACTTCTGGGAGGCAGTTTACAGATGCCGCCTCCAAGTCATCAAGCTTAA
ATGTTTTAAAGGTTGAGCCAATAATGATGGTTTATCAATGTATCTGTCTA
TGTACTTCATGAATTCCCCGACCACATACAATCTGTGCATATACTTTCTA
TGATTGCAAATTGATCTAAAGTCCCACTGCAGCATTTGGGAGAATCCCCA
CTGCCCACTTATGAACCTGTTTTTGACTGGGAAACTGAGAGGTCGACAAT
ATTTGGGCAAAGGATCCCAGAAACTCAGCTAGCGCAATATGCCAGGTCAA
TAAATGTTTTGGAGTAGAATTTGAATATCTTTGATTTTAGTGTTTGTTTA
GTTTCTTCTCTTTTACAATGTTGTTTTTTAAAGTTTGTTTACTTCCATAA
TCTCGTGTTGTAGTGGATTGAAGATATCAGTTAAAGTCCATTCCTTGTCA
TTTCAAGCGGGACTAGTGGGTGAGCCTTTATGCCTAACTACTAGATGCTT
ATACCAATTTCTTTTTCTCACAATAGAGACTTAAAGCCTTCTTTCAAATT
GTAATGTTATATTATCAAATCTTATTGCAGAGCCATTTTACGGCACTATC
TGTTTGTATAACAAGGAAAGGAGGGAGAAACTCTCAGAGGACTTCATTTT
TTCTGCATTACCCACAGAAATGCAGGAGGTAATGTCCCCCCCCCCTCCCC
CACCCCACTCTCTCTCTCACACACACACACACACACATGTCCTAACTGTC
TTTTTAGGTATTCTTCCGCTGTATATACTACAAATATAAATTGATATGAT
CTTTACTGTCATCTTTTGTGACTACTACCAGGCTAGCAGTTCCTATGAAC
CTCGTGGTATTTTTTATTTAGATACCCCATCAGCATCAGTTTGTCTTCTG
ATCCAGTTAGAGAAGCCTGCCACAGAAGAAGGTGGGGTAACTCCCTCTGT
TTATTCACGTAAAGAACCGGTATGTATGGTTCCCCCAACAACTTATTGCA
TAAGTTATATTCTGTTTTAAGCGTAAGTTAGGATTGCATAAGTTATTCAT
GTAAAGAACCGGTATTCACGTAAAGAACCGGTATGTATGATGTTGTGGTT
GTTGGTGTATGTTGTGCATATCCTTTGCAGATATAGAGGAAGGCTTAGTG
TGTATGTTCTTCCGAATTCATGTTTACATTTGTTTGATTAAAACAGGTCC
ACATGACTGAGAGAGAAAAGCAGAAACTCCAAGTGTGGTCCCGCATCATG
CCCTACAGGGAATCTTTCGCCTGGGCTATTATTCCATTGTTTGATAGCAA
TATTAATTCTTCCCCTGGCGGGCCTGCTTCTCCTAGTAGTTCTGTTGCTC
CTAATGTGTCCGTATCAAGTTCACAAGACGCCTCTGATCCTGTTGCAAAG
TTAGATGGAAAACTAGGTTACTCAAGCGGAAACTCTGTTGTAGTTGAAGT
ATCAAATTTAAATAAAGTTAAAGAAGGGTATACTGAGGACTCACTCCAGG
TCTGGTAGCCAATTGCATGAGTTTTTTTATTTGAATTATATTTTATTAAA
TGTTCTTTTTTCAACATTTTATCTCCCTTGTGTTTCTGTTCTAGTATCAA
AAAGGTGGTTGTTCTAGGTTATATACTTGTAATTTAATAGTTTTCGTTGG
TATTTAATTAAGCTATATATATTTGTGCTGGAAGACTATGGTCTTGTACA
ATTTGCTACACATTACCTGTGTCTGTAATGGGAAGAAGGTTCTCTGCTTT
AGTTTATGCATATTAACTGCACACTACTTGTAAATTGTAATTAACCTATG
CATTACTAGAATAAATGTGTATGGAGCTTGAAGCAGACAGGAGATAAAGG
GCAACGGTAAAAGCGTTCCATTTCCTAAAAAACACTAGTAATTCTACTGT
TGTAAAGATTATTGGCTTATGGTATGGAAGTGGTTAATTTGTACTGTTAG
CGTGTATGGTGCTGGTGTGTTTCATGTTGATTGAGGGAAGGGGGCAGAAT
GTGGTGTTAGTTTGGACTCAATTTTTAACATTTGAAAAGATAGTATCCTA
CTCTATTTTTTTGGAATTGCTAATTTTTTAGAATCTTAAATTGTTAATAG
CCTTGTCCTATTTGTCACTCATATTAATATTATTGTTATGTGTTGTAACT
TGAGCTAATGGAGGCAATTTGTTGACTGGGTCTTTTGCTCTCTGTATTAG
GATCCCAAGCGGAAAATCCATAAACCTGTAAAAGGAGTGCTGAGATTGGA
AATTGAAAAGCTCCAAGCTGGTCCGGTTGACTTTGAAAATGCTTCAGAAG
GCGGAAGCATTGATCATGAAGATCAAATTACCGATTCAAGGTTTGCAAAG
TGTCCCAGCAATGGTTCTGATGGACCTCAGAATGGGCATTCAAAAGTGAA
TTACTATGAAGGAAAAGAGTTACCTCGAAATGGATCAATTGCTTTGGGAA
ATACAGATTTAAATACTGATGATGTGAGTGCAGCAACTATTTCATGCACC
TTATAATATACCATTACATCTAATAATAATTGTACATTTCTATTTGTCCA
GTGCTATCACTGCTATCTATTTAGGTTGGTTGATAAAACTTGATATACTT
TATAGTTATTCGTGCATTTCCTTGTGATATTTTAGTGTACTTTATTTTGC
AAATATCCAAGATGGTGTAGTTTAACAACACACCCTTTTAAGATAAAGAT
AACATCTTGTGACTAATTAGTTTATGATTTGTAAATTTTTTTTCCTTGTA
TAATTTAACATTTTAGGTTCTGCTTTTAATTCATAGATAAGATTCATCAA
ATAGGGTGTATTTTCTTTTGCAGCAGTATTTTGTGTTATTTCTTCTTCAG
AAAAAATTGTATTGTTGTTATTACAGTTCCAAGCCTTCGACTTCCGAAGA
ACAACAAGAAACGAGCCGTTTCTGCAGCCATTTCATTGTCTCTATGTTTA
TCCAATTACTGTAAGTTTGAGTAGGAAAAGGAACCTGTTTATACGTGTTG
AACTCAGGAAGGATGATGGTGATGCTCGTAAACAACAGCCATTGGAGGTA
AGTGGTGTTTATCTTCAAGGCGGTTTTCCTTCTAGATTTCATTGTTTTGA
GCGGTGATATATGGTTTGTCTTTTATCAGGCAATGCATTCAAGGGAACCT
GGTGCATCCCTCCAGAAATGTGCCCACACACAAGTTGCTGTTGGTGCTAG
GATTGCTTCTTACCATGATGAAATCAAAGTTTCACTTCCGGCAATATGGA
CACCATCGCATCACCTTCTGTTCACTTTCTTGCATGTTGATCTTCAGACA
AAACTAGAAGCTCCAAAGCCAGTAAGTTTAATCACGTTGATAGCACTCGA
ACTGATTATACTTGGTGTGATGCCCACCTTTCATTGTAGCGCCACATCTA
CACTATTATATTTCATTCATTTGTATTCTGAGAATGTAACTACTTTAAAT
TGTTCATTGTTTTCCTTAACAGTTCCGATTTTGATCTGTACAGGTGGTAA
TTGGATATGCATCACTCCCGTTATCAACACACGCACAGTATGTAATTTGT
CAGAATCTTTTTTGGTTTTTGTAATACTAATTGTCTAATTGCATATTTAC
GTTATAAAAGGTCCTTTTCTTTGGTATAAACACCAGTAGGTAACTAGGTT
TTTTTAGAAATATAAATGTAACTTTATTATATAAATATTAGTGCATCTTA
AAATTAATTATGGTCATATAATTACAGCTTCAGATTAAAAAAATATTGAT
AAACATTCAACATTAACGAAACTTATTGTTATCATACTGGTGTATTTGTA
TAATATTTTTAGTAGGTATTTGTATAGGGCAGGGGATCCTTTGCACATTT
TTTATTTTGGGGGGGGGGGGGGGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTTTTTTTTTGGGGGGGG
GGGGGGTGAGAGATTTTGGATGCTCTGAAATATGTCTTTTAGGGATACAG
TAATTTTTCTTCAAAACTATGGAAGGTCTGGGCTGTCTGTTGTAATTCTT
TACTCTAGGCTTACTGTTAAATTTCTAAAGAACTAAATGATAACCAACTT
CATGAAATTATTTAGGTTGAGATCAGAAATTTCACTGCCAATAATGAGAG
AGCTGATTCCGCACTATCTTCAAGACGGCGGAAAGGTATAAGCTTGACAC
TGACAATATGCTACACATGTCTTTATCCTATCTTTATTGTTATATTCTCA
AATTGATTCCACCTTTATATTAGTTAAAATGTGCACTGCTTGTCGAAATA
GTTTTAAGCTCTAATTATATCGACTAGCAAGATTATTCTGGACTTTGGTA
CATACGTAGTCTTGACAAGAAACTAAACCCTGACATTTACTACCGTGAAC
AGAGGAAGCTGCAAACGTAAGGATATGTACACTTTAACCTTGAAAATTTA
TCTAGTCAAATAACTTAACCTTACTGTCTCTTTAGTGGCGCCTTCTATCA
AGTATATCGAGACATTTGTGGTGCCAGTTTCAGTTAAATAAATTCTAAGA
CTTAAAGTGTACATATCTGGAGGTTTAGCCGTGGTAACGGCACTCCACCA
TGACAAAGGTCATGAGTACAATTTCTCGCTCCCCCTCTCCTATACTTGCA
AAAGAATGCAACTTTTAAAGACAAATATGTACTTGTTTAAATGTCAGAGT
TCTATTTGTTTATGTGCCATTTCAGTTGTTGAGTCTAATAAGAACTTGAA
GTTTTATAACTAATACTAATTGTTTTCTGGTTAGGAGGTTTGATCAATTT
GCTTGCTTTTTTCCACTTAATTTATATTTTCTACAGTTTTTATTGTGATA
AAAAAAATTCACAATATATATTTTACCTTCTTGATTAAGTTGTCAAAGCC
GCTCATTATTGTCGTAATATATGTTACCTGATACTCGGGGGTGTTTCAGG
AAAGGATAGATTACCTCGAGGATGGCAAGAATGTATTTAAATTGCGATTA
AGGCTGTGTTCATCCTTATATCCAATTAGTGAGCGCATTAGAGATTTTTT
TCTCGAGTATGATAGACACACACTCCGAACAAGTCCACCTTGGGGATCCG
AACTACTTGAGGTATATTTTATATTATTTGGTTTACTGATACTGTAGTTG
AAATGTTTTTACTGATTGTTTTTAAATACAACTCCTAGAGGTTCCATCTC
TTTTGTTGCATTTGTCGCTTGTTTTGGTGATGATGCATGTTTTAAGTTGG
TACTAACTGCTGAGTGTTAATGCTGTATATGTGATATATGTGTACAAGCG
GTGTCTTTACTGAAACAATGTACAATTTTGTATCCTTTCAGGCTATTAAC
AGCTTGAAAAATGTTGATTCAACTGCTCTGCTTCAGTTCCTTCAGCCAAT
ACTAAATATGCTTCTCCATCTAATTGGAAATGGTGGAGAAACTCTTCAGG
TTTGCCAATGATTTTATAAACATCTTAGGATGCGTTCATCTTGTTTCTTA
ATGAATTGAGTTCTTACTTCCTTTCTGATATTTCTCTCTATCAGAAGACA
CTTGTCAAGCTTTGAATTTTTACCTGGTTGCTTTTTTCTTTCTCTTAGGT
TGCAGCCTTCAGAGCCATGGTCAATATACTAACGCGGTATGTATATTTAG
TTCAAATTCAAATGTTGGGCACAGATCAATTTGTTAGTTTTAGTAACAAG
TAAAAATGATCATGGTCACAAGCAAGTTTGCATTTTGGTAAACAAGGCCT
TTCTTAACCATTCTTATCTTGATAATAGAAAAGTACCATTTTAGTTCCAA
GTTGGACTTTTCTGGAAGAATGTTCCAAGTGACAATTAAACATCAACACA
CTATAATTAATAACATAAAGATCTGTAATGTTATGCTTGCATGCAAATAT
TGTCAACTCGTAGAAGTAGTATCTAATCAGTAGCTATGCAAACTTAAGAT
TTAGGGAAAGGTTGCATTATTTTCTCAGCTCTGGTCAATACTTCAAGTCT
ACTACCAGTGGAGTCACTCTTTTGTATTTTTTATAGTAAATTATCAATAG
CATGGAATGTTGATATGCAGGGTTCAACAAGAGTCAGTTGATGAGGCTGA
ACGGAACATTTTTCTAGTGAACTATGTGGACTACTCCTTTGATGATTTTG
GGGGTCGTCAACCACCTGTTTATCCTGGTTTATCAACTGTATGGGGAAGC
TTGGCTCGCAGTAAGGTGAATACTCACATCAAATTTTGTGTCGACTTGTC
AGTATAACGGTCACTTGTCAGTTTGCAAGACCTAGCTACTGCTCTTTCTA
AACAGATATGATGTATAGGTGTAAAATTTCTTCTTGTTTGCTCTAATTAA
ACTTTTTTGATTTGTAAATCACTGCATGTTACAGAATGCAGACATTTCAT
GTTTTAGAAGTTGAAATGGTTATGTTACCTTGTACTTTTTAATTTTTGCT
TTGACAGGCAAAAGGATATCGTGTAGGACCAGTTTATGATGATGTCTTGT
CAATGGCATGGTTTTTCTTAGAGTTAATTGTCAAGTCGATGGCATTAGAG
CAGACTCGGCTGTTCTATCACAACCTTCCACTTGGTAATTATTTTTCAAA
CAAAGTGTTTTGTGGCATGTTCATTTATTCTCCACTTGAAAACTAAGTTG
TGAAATCTGATGTTTTTTTTTTGCCTTCCCATGAAGAAAGTCTCACTTTG
TCTGTAAATGATTTCCCTTTAAAAAATTCATTACAGTTCTCCCTTTCTTT
TGCTGGTGACTGAGTAATATAGAAGTAAATATATCTATAAAAATTCATTA
CAGTTATCCCTTACATTACCACGCACCGGCGCACCCGCACCCCCACAACG
GTGCGTATCCCGTACGCAATATTCCACCCATGTGGAGTATTCCTGCTTTG
GGGGAAATATTGACCGCATATAATGTGAAGTTGAGGTTTTTTTTAATTTT
TTTTTAAGACAATGACCTCCATGGAATTAAATACAATACCAATGCCAAAC
TACAAGGGCTACTTGGGTTGTCATAAACTGCTTAGTTCTTACGATGATTT
ATCTTTAACCTGGGGCCAGTGCTAGTTTGTAGCCATAATTTTTTTTAGTT
AATGGTAGCCTTGATTTGTATTCTTGCTTCTCCTAAGCTTCCAGTGCGAG
ATCTCATCAGGTATCTACACGACTGTTCGACTGATTCGGGAAGGGACCAA
AATGCTGAACCTTTTTACATCTCATGTTTGTATGGTTATGGCAGACTTCT
TGTTCCTCCATTAACGACAGGCTAAGAATATACAAATTATTTGCTTATCA
ATATCAACAAACAAACAGAAGGGAAGCATAAAAGGAAAGAACATAAAAAT
TATTGCCAGAGATAACTGATTGCCTATAAGTCTAGTTAGTTGATTGTTTT
TTTTGTTTTTTTGTGCAATAGGTGAAGATATTCCTCCCATGCAGTTGAAA
GAAAGTGTTTTCAGATGTATACTGCAGCTATATGATTGCCTTCTAACAGA
AGTACATGAGCGTTGCAAAAGGGGTCTAAGCTTGGCAAAACGCTTGAACA
GTAGTCTGGCGTTCTTTTGCTATGATCTTTTGTCAATCATTGAGCCTCGT
CAAGTATTTGAATTGGTATTCTTCACCTTTATCTGGCATTTGGACTTTCA
ATCTTTCACACTCATTTGATGTCATCAGCTTTGTGTTGAGATGTTCATGT
CAGATGAGTTTCTTTCTTCTTGTCCCTGCGTTATGTGTTTCCTTTTTTGC
ATGCGCTGACTTCATCTTTGTAGGACACAAAAAGTCAGAAATTCAAAATT
CTCAATCATTGTTACATAGTAGAGAATCTTTATTTGAATATACTTCAAAA
TTTTGAAAGAGATCTGAAATTCATTTCATACTTTAAATCTGCGTAAGTGA
AAACATGAGAAAAGCTTTCTCTTTACTGTACTAGTATCCTTCTTTGTGTT
TGTAATTTTTTATTTGTGAATTCAATACAGATGATAGATATACACATGCA
ATGCACGCCCGAACACAGAAACACACACACACACACACCAGGCTAACTGA
ATTTAGAATACAACCATGTTTAGCCTTTGGCTATATCTATTTTGCATGTG
GCCAAAGTTAGTCGCATCCCATAATTGGCTATATATTTTTCTTGTGTTTG
ACAGTGTTTCCCCATCTTTCAGTTGACGGTTAATGATTATTTACATTTCA
TGCAGGTCTCTCTGTACATTGATAAGTTCTCTGGGGTGTGTCAGTTAGTG
CTTCATGATTGCAAGCTTACATTTTTACAGATTATTTGTGATCATGATCT
TTTTGTGGAAATGCCTGGGAGAGATCCTTCAGATAGGTAACTGTTTGGTT
TTCTTCAGTACAGTATCATTGAAAAGGTTAACCAGCTGGCATCACATTGT
CATTTTTGATACCCACATTTAGTACACTTTTTCATCCTTCCACCAATTGA
ATCTTTTCACAAAGAACATATCATTCACATCCCATTTGATAGGCTCATAT
ACCTAAAGATATTATTTCCTCCTATAAGGTTTAGGGACCCATTTCATATG
TATTTGAAGCTACCTGCAATGAAGTACTTATATAGTTATATGTGATGCTT
CCTAGATGTTATATCAAACACTGATTACCAGCATACCTGTGTATTATAGC
TTCCAAGAGAAATTCCTTTTTTTTCCCCGGTAATTGAGTTGTGAGCTATT
TGTAAACTAGTGCTCTGCTGAATTTTTCTTGGGCAGAAATTTCTCCTAGT
ACACTTCATTCAAGGAAGCAAAGTTGTTGCTTGAAGCTTTTCACCAAGTC
TTCTAATATTTTAAAATATAAAATGTCAAAGTAGTCCCACTGAAGTTGGG
TATAGGACCTGTGACTTGTTTAATAGAGGTTGAGATTTTGAGTCGCAGTG
GAGGCAATTTGTGTGCGAGAATATATATTTATGTAATTGACCATTTCCAA
CATCAAACGTAGAATTGGAAATGGTTTTACTCAGAAACTTATTGTCTTCA
GTTGCAATGAATTATAAGTGACATTTCATAGATGTTCATTACATGAGGTT
GAATGAAGGGCCTCTTATAGGTACATGATTGGTGGTTGTCTTTGTTGACA
CATACTAGTTTATTTAAGTCTCTTTGTGTGCCTGCAAGTATGTTTACATG
TACATAAAGTCAGATGCCTGTGAGTTACTGGGCATTGTAGCTTGCAATGT
AGTAATTTGTGTGAGGTCTAGACGTGATGAAATCCAATTAGGAGCTCTCC
AAGTGTACACTCACCGTTACTGATTCCTATTTTGCTTATCATGACGCAAA
CACTTCTATGGACAAAGTTGTTCTCATAAATAGAGTATGCCATGTTGTCT
TGCTTGGTAGTAAAATTTTCATAAAACATGAAATATGCCTGACTTTGTAT
CTATGCATTTTGCAGGAATTACCTTTCTTCTGTCTTGATACAAGAACTTT
TCTTAACATGGGACCATGATGATTTATCTCTGCGGGCAAAGGCGAGTCCA
GTATTTGTTATAAGCCACCGTTTGATTTTAATAGTTTGTATGTTTCCAAG
TTAAATCTTTCATGACTTTTTTGGTATTTGTAGGCAGCTAGAATCTTGGT
AGTCCTTTTGTGCAAGCACGAGTTTGATGCTCGTTACCAAAAGCCTGAAG
ACAAATTATATATTGCACAACTGTACTTTCCCCTTGTTGGCCAGGTTTCT
AACATTTATTTCGTTTATTTGTTCTGTATGATTTGTCATCCTGTGGAATT
TTGTATCACATTTTGTACTACTGATATCTGTATCCAATGCCGGTATGTCC
TTGTGCCTGACTAAACTGCTTCAGCTGTTCCAAGCCTTCAGAATAGACAG
TATGGCAACAAAACTGCACTTTTGAATGCATGAAGTCCTTTTCATTTCCA
AAGTATAAATTCAGAATTACCACCGAGTGTGAGAGTAGTGGTAGCTAAAT
AAATGTAAAGATGGACACTACAATCTGTGCTAGTTTATTTTTTTAATAGC
ATACATCACCATAAATTTATTTCTGCGTTGTATGATAGTGGGTAAATCTG
TCATGGTATGTCGTATTTTGCAATGCCGATGTTAGAGAATCCACATTTAT
CATTGCTTTTTATTATGCAGATTCTGGATGAGATGCCTGTATTTTATAAT
CTTAGTTCTGTTGAAAAACGTGAAGTCTTGATTGTCATCTTGCAAATAAT
ACGTAATTTGGATGATGCATCATTGGTGAAGGCTTGGCAGCAAAGTATTG
CTCGAACCAGATTATTTTTTAAACTGTTGGAGGAAAGCTTGGTTCTGTTT
GAGGTTTGATCTCAACTTCTGGATGTTCTTATTCATTTTGTTGCTTAAAG
TTTAACATTTGACAACTTCAAACTCGTGTTCATTATGTATTCTGTAATAT
TGTGGCAGATGCAACATATGCATTTAATTTGAACAGCATTGTTGCATATA
TCCAAGTGAATTTCTTTCCTTGTCAACTGCAACCAAAATTAGTGAACTAT
CTCTTTGAAATTAATTGTGATGTAGTTAGACTCATAGTCCAAACTCTAAT
GATGTGTTAGTAATGAAGTAGATGTTACTTATTCTTCTTTTGTGACGAGG
AGCATCCCAATAGTTTCCAAGTCCATTCATGAATAATGTAAACAATTGGG
CTTCTAGTAACTTGGTACAAAAAATATCTGTCAGATTCCTTATACGTGGC
AGTCTTCAGCAAATGCTCCTCAGGCTTACTTTGTATTCATTTTTTTGTTA
TTGAAAAGTGAAAGAATTTGATAAACAATATTAGTTTAAAATTATTTAAA
AGTAGGAGAGTTTCCCTATTGATGGAGGATGAAGAGATTCTTAATAATTT
GAGGGGTTGCTAAGAGACTATTGGTTTCTGATTTTTAGTGGATTCTTCTC
AATATTGGGTTAATTATCAAGTTGGTCACTGAATTGGGCTTAATGTATCA
AGTTGGTCAGTGAACTCAAAACGGTATCAAGATGGTCACTAAAGTCACCA
TAAATATTAAACAAGTACCTTGAAATATGAGTTCAAGCAGTAAAAATATT
ATTTATAAAGTTTTACACATTATTTTTAAATGTTACCACAACCAACTAAA
AGGTTATGACTTCTAGTATTTAAAATAATATATTTATATTTTATCAAATT
TATTTATTATTTATATTGTATTATATAGTTATTTCTTTGTTTGAATTAAA
AATAAATAATAAATAAACTTGATAAAATCTAAATATATTATCATAAATAT
TAGAAGTCATAACCTTTTACTTGGTTTTGGTAACATTCAAAAATAATGTG
TAAAACTTTATAAATAATATTTTTACTGCTTGAACTCATATTTCAAGTAC
TTGTTTGATGTTTATGGCCACTTCAGGGATCATCTTGATACCATTTTGAG
TTCAGTGACCAACTTGATACATTAAGCCCACTTCAGTGACAAACTTGATA
ATTAACCCTAAATATTCTTAGGAGCTTGAATGAAGAGCCTACTGTAGATG
CTCTATGCTATCTCATAATGTAATTAAGAATTCTTCAGATAGCCATTGTG
AAATTTCCCATATTAAGGTTGGTACGAGATCCATATTAAGCATTGAACAC
TAATGCAATGAATCTCGTCATATCTCTCATATTAAGCTTGTTGCCCTTTG
GTTGAGGTTATTATCATTTTAAGCCTGTGTGCATCGACTTATTCTCCTCT
GTACTAATTGCATAATCTATAATATACAGCATAGGAAACCTGCTGATAGC
ATGCTTATGGGCGCTAGTTCTCGCAGCCCGGTTGCTGATGGACCTGTCTC
TCCTAAATATTCTGACAGGCTTTCACCTGCCATTAACCACTATCTATCGG
AGGCATCAAGGCAAGAAGTCAGAGTAAGTTCACCCTTTATTTTATATTTT
TGTGACTAGTTCCCAAATTTTTTCTTCAGAAATTATATTTTTTGATTATT
CATGAATATATAGGTCGTCCTCGCAGCAATATTTTCTAATTATGTCAAAC
TTATGTTTAACATTTTCCTGTGAAGCCGCAAGGCACTCCTGAGAATGGAT
ACATGTGGCAGAGAGCAAATTCCCAGTTAAGCTCTCCTAGTCAGCCATAT
TCTTTAAGAGAAGCACTTGCTCAGGCACAGTCATCTAGAATTGGCGCTTC
AACTCAAGCATTGAGGGAATCTTTGCACCCAATCTTGAGGCAAAAGCTTG
TAAGTATAGTCAGTGTTATGCTGATACCAGCATTGTTGTTTGCTTATAAT
GATGACTATCTAATCATTCTTCTTAATTCTGCATTGAGCCTTTTTGTCCA
TTTCACAACAAAACAAATAATGAAATAGTTAGCTAGTCAACTTATAATCT
TCCCTTACTTCAGGAACTTTGGGAAGAAAACTTGAGCGCTGCTGTCAGCC
TGCAGGTCTTGGAAATAACAGAGAAATTTTCCAGTACCGCTTCGTCACAT
AGTATCGCCACAGATTATGGAAAACTTGATTGCATAACATCCATATTTAC
AAGCTTCTTCTCACGTTATCAGCCGCTAGCATTTTGGAAAGCAATGTTTC
CGGTGTTCACCAGTGTCTTTCAGCTTCACGGAGCAACACTAATGGCAAGG
GAAAATGATCGATTCTTAAAGCAAATTGCTTTTCATCTTTTACGTCTTGC
TGTTTTTCGAAATCACAATATCAGAAAAAGAGCTGTGGTGGGCCTTCAGA
TACTCGTCCGGGTAGGCTTGCGTTTGCGTTACCTACTATTGCAAGTTGCA
ACTGTATCCTCTGTGTGCTACCTCTGGATTTTAGTATCATGTTGCTTTGT
TACAACACTCGTTCACTTTTCATTTTGTAGAGCTCTTTCTCTTACTTTAC
TCAAACGGCAAGGTTAAGGGTGATGCTGACCATAACATTATCGGAGTTGA
TGTCTGATGTTCAAGTGACCCAGATGAAGTCTGACGGAACGCTTGAAGAA
AGTGGGGAAGCACGCCGTCTCCGGAATTCTTTAGAGGAAATGGCGGACGA
GTCTAAAAGTGGAAACTTAATCACAGAGTGTGGTCTACCGGAGAATGCAC
TTGGTACTATTCCAGACGCATTAGCTGAGAAAAAATGGTCGTGGTCGGAG
GTGAAAATCCTTGCCAATAGCATTATTCTGGCTCTCGATGCTAGCTTGGA
GCATGCACTCTTGGTAATTTTTGTCATCCTGTTTGCTTCTACTTGGATTA
ATACTCGGAACAAGTACCAGGAATTGATATAATCATGTGGAATGCATTTG
TTTACAGGCTTCTGTTATGAACACGGACAGATATGCTGCCGCAGAAAGTT
TCTTTAAACTTGCAATGGCATTTGCTCCTGTACCAGATCTCCACATAATG
TGGTTATTGCATCTTTGTGATGCACATCAGGAGATGCAGTCATGGGCTGA
AGCTGCACAGTGTGCGGTGGGCGTTGCAGGTGTTGTAATGCAGGTAATAT
TGCAATTGTCTGTGGGGTTGTAGTTAATTCTTCTTAATCTAATTACTAGA
TATTATCGAGAGCTAATTGCATTTCGCACCCTTATACTTTGGCCCAAAAA
CACTTTAGTATGCAAACTTTAGATAATTGCACTTCGCCACCCACTGGTAT
TTTGTGCGCGGAAATATGCATCCCTTCCGTCAAAAAATTAACGGTTCCGT
TAAAAAATTGAGCGCAATTGTGGCATTTAAAAAAATTAAAATATAAACTC
ACTATTACTTGGTTAATTAGACAGTTTAATAAAGTAACTCCACATGCCCC
CCGCCCAAACCTCAAACAGAAACAGCGCGCCCAAATCCAACCTCAATTGA
CAAAGATTTCAGCTGTCCATTCTTCTCTCACAGCGTGATGAACCCAGCTG
CAAAGATCAATGCCAATGGCTTCTGGTGGAGCAGAATGATTAGGTATGAG
CTTAGTCGGGTCTGCAATGCTTTTCATTGTTATGGGAGCTAGAAAACTGC
AGTGTGCTTCAGAAGCAAGATTGGGGCTTCTTCATGCATGGTTTGGCCCA
ATGCTCTTAGACTTTGGTTGGTTACAGAGTGTAAATAGGGGCTCGACATA
AAGGTGCTGGAAGAAGCCATGGGGCACGTGCTCCTTACCCTTCCTCTTAA
GCATCAATACACGCTGTTTAGGGCATGGTTCCGCTGTTTCTCCAGACATG
GCACTGAATGCCCAAATATCAGTAAAGCATTTCAAATTTGGTGGCGGCGT
TTATTGTTGAGTGGGTCTGTATCTATTGCAGTTGAGTCCAGGTGATGGTT
GGGACAGTTTTTCTAATTGTAGTTCAGCGTGTAATATTGCAGTGTAGATG
TTTGATACCAGCAGTCTAGAACCTCTAATAGGTCTAATGAACATGAGATT
AGGGCTTATATAAAGTAAAATGGGGAAGAAGACAGTTAGAAATCAATTTT
CCCGTTTTACCCCTGCTAAGGTAACGCTAAACATGAATATTTAACGGAGG
TTGTGAGAAGGGGTGCATATTGCCGACAAAAATTACTAGTGTGCGGCGAA
GTGCAATTATCTAAAGTTTGCATACTAAAGTGTTTTTGGGCCCCAAGTGT
AGGGGTGCGAAATGCAATTAACTCTATTATCAAAGACAATATTTGGGATA
CAGAATGCATGTTTTTTTCTTGTCTATATTCATATTTGTATGCTGGTAAT
TACTAGATACTATGACCTAGCATTATAACCTGAGCACACGCTGATGCATG
TTGCTCTTACCACTGTGAAATTTTCTAGTTTCTAATATCTATAAAGAGTG
TAGAAGAGAAACATGTATATACCAAGTTGAGTTGTGCAAATATGTCCTCT
TTCTCTTTTCTTTTCTTTTTGCATATTTCTTCTTTAACTTGTAGGTTTTA
ATTCACTATGCAATATAAATCTGGTTTTAGGGGGAATGTGGACTAGGCAG
CTCCCAGGACATGTGCCACAACCATACACTGAACTTCTAATGTTCCCTTT
GTTGTTTCCTGTATTAGCATTACATTCTTTTGTCAAAATCTTATTCAAGC
ACATATGTTGTTGATAGGGTTGCCTATTTATGTACCATGCTAAGAATTAA
CGTAAGCATAATATATAGCCTTGGGGAAGGGGGTATGTTTTACAAGTCAT
AATAACATCTTTGTATGACTTTGAATATGCAAACATTCATGGGTTTGAGA
AAAGAGAATCATACAAGATGATTCTCTGGTCTGTTGTTGAAAGTAATGCT
ATTGTCCTCTTACCTGCTGTGTAAATATAAAGCAATACTTCCAGAACATT
AATTAATGGGTATTACCTGTGTTTTATGTGAACAAATTCCTAGTGATGAA
ACATAATTATCGTCAATTAGTTTTGTTCAGAAGATCCTGTTTAGGTTGGG
ACCAATTCTGCTGAGAATTATTATTTTGGTAATCTAGTAAAATGATCTGC
GACAAGTATTCCAACCTTTTCAGAGTGTTTAATTTATGTATATTTTTATT
TTCTTTTCTAAGGCATACCTATTGAACAGAGTTCCGGCCTATCTGGATGT
GGTTAGTCTATAGATCAGACAATGACATGCATTTGTTGTCATAATTTTTC
TGCCATTTCATTCATGCTTCCGTTGTAGTTTGTTGACATTTATAATGATT
TACATATAAATGGTTTTCAAATTGTCTAGTTCCTTCTAACTATGAACATA
TTATAGGCTCTCGTAAGTAGAAATGATGGAGTCTGGGGCAATGATCATAT
TACTGCACTACGCAAAATTTGCCCCATGGTTAGCAATGAGATAACATCCG
AGGCCTCTGCAGCTGAGGTAGAAGGATATGGTGCTTCGAAACTCACAGTT
GATTCTGCAGTGAAATACCTACAGCTAGCAAATAAGCTTTTTTCTCAGGC
TGAGCTCTACCATTTCTGCGCAAACATTCTCGAACTTGTAATTCCAGTTT
ATAAAAGCAGGAGGGCATATGGACAGCTAGCCAAATGTCACACAATGCTA
ACCAATATCTATGAATCAATTCTTGAGCAGGAATCAAGTCCAATTCCTTT
CACTGATGCCACATATTATAGAGTTGGATTTTATGGTGAAAAATTTGGCA
AGTTGGATAAAAAGGAATATGTTTACAGAGAGCCCCGCGATGTTCGATTG
GGCGACATAATGGAAAAACTTAGTCATATATACGAGTCAAGGATGGATGG
TAATCATACCTTGCACATAATTCCAGATTCTAGACAAGTCAAATCTGAAG
AACTGCAGCCTGGAGTCTGTTACTTGCAGATAACTGCTGTGGATCCTGTT
ATGGAAGATGAAGATTTGGGAAGTAGAAGGGAGAGAATAATCTCTCTTTC
TACAGGAAGCGTCCGTGCACGTGTCTTTGATCGCTTCTTGTTTGATACCC
CTTTTACAAAAAATGGCAAGACCCAAGGTGGATTAGAAGACCAATGGAAG
CGACGGACTGTTCTTCAGACTGAGGGATCGTTTCCTGCCCTTGTCAACAG
GCTTGTTGTAACAAAATCAGAATCTCTTGAGTTCTCTCCCGTAGAGAATG
CAATTGGAATGATTGAAACTCGCACGGCTGCATTAAGAAATGAGCTTGAA
GAGCCTCGCAGTTCTGATGGTGATCAGCTCCCACGTTTGCAGAGTCTACA
GAGAATTCTTCAAGGCTCTGTCGCAGTTCAGGTAAAACTTCAACACAAAT
CTTTGCACTTGATTTTATGGTATTATCTTTTCTCAGTCATATATATATAT
ATAGAGTCCTACTCCAATAGAAACCAAATTAGCCTAAAAACTAAAAACCA
GTTTCTGGACAGTTTTTTATCACTATTTTTAACTACAGAAATCACTAATT
TGTACATAACATATCACTAATTTATATATAGCATATCTCGCGAATATAAA
TATATATATACACATATATACAACGTATATGACCATCATCTTCACCCAAA
TCGTAATAATGGACCTCTTACCACCATTACCAAACGTTTCTATGACTTGC
CACCATTGTCTATCATCACCAATAGTCACATACACTTTCCATCATAACTT
ACAAAACTAACGACTACTTACCATCATCATACAACTTCTCTTGCGGCTTC
CTACCACCAAGAACCTTCCTACGGATGAAATTAATCATCTATAATCGATT
ATCAATAATTTAGATTAGTAGATTTTCTCAAATTTGATAATAAAAATCGC
TGTTTACATACTGTATAAAAACAGTGATTAGTGCAGTATAAATTAGTGAT
ACCCGTAGTTATAAATAGTGGTAGCGTAACTGGTTTCTAGTTTTTATTTT
AAGAGTGGTTTCTATTTGATCATGAGCCTATATATATATATCTCTAATGC
CACTGCTGAGCCTGTCTTAGAAGTTAGAATGGTGTCTGCTACATATGATT
TCCTTTATGAAATGAATATCTAGTCCATGCTCTAATCACCCTTATATTGG
TATTAACAGGTAAACAGTGGCGTCCTTAGTGTATGCACAGCTTTCCTGTC
AGGTGAGCCAGCGACAAGGCTGAGATCACAGGAGCTGCAGCAACTCATTG
CTGCTCTCCTTGAATTTATGGCTGTTTGCAAACGTGCCATTCGTGTACAC
TTCAGGTTAATTGGGGAGGAAGACCAAGATTTCCACACACAGTTAGTCAA
TGGGTTTCAGTCACTGACTGCAGAGTTGTCTCATTACATCCCTGCCATTC
TTTCCGAGCTCTGAAAATCACTAGTGGTCTTTGTTAGTGTAATGTGTTCA
TATTGTTTGTACAAGTTTTCTGTAGGTTCATGTTGTGTTCTTGTTCATAT
AATTATTCATCATTTGTTGATATATAATTTTTTTTATTCATTTTTGTATT
TTTAACTACAGTGTTTTCCCCTTTTTAAGTAACCTGTCCAGTTTAGTTTA
ACTGAATGTTCAAAAATTTGATTAGCACTATGGTAGGGTTTGACTTCATA
CAAGAGCAACAGAGCCTGTTTGTTTGTCGAAAA
Sequence Length:
21033
Sequence Checksum:
35d4417e5a82a039a2284eedc394cd97
View location in JBrowse:
Gene:
LOC108202588
Gene Biotype:
protein_coding
Gbkey:
Gene